二手基因測(cè)序儀 二代中三*性能PK

二手基因測(cè)序儀 是測(cè)序產(chǎn)業(yè)鏈的起點(diǎn)也是關(guān)鍵環(huán)節(jié)，它為整個(gè)中下游測(cè)序服務(wù)提供基本的測(cè)序支撐，同時(shí)也處于基因測(cè)序產(chǎn)業(yè)價(jià)值鏈頂端。基因測(cè)序儀對(duì)于基因產(chǎn)業(yè)的重要性，如同發(fā)動(dòng)機(jī)之于汽車行業(yè)，芯片之于電子通信行業(yè)。

基因測(cè)序也稱DNA測(cè)序，是現(xiàn)代生物學(xué)研究中重要的手段之一?；驕y(cè)序技術(shù)經(jīng)過(guò)了三個(gè)發(fā)展階段。

一代測(cè)序：指雙脫氧末端終止法，擴(kuò)增后通過(guò)毛細(xì)管電泳讀取序列，每次獲取數(shù)據(jù)量少。

二代測(cè)序：為高通量測(cè)序，采用微珠或高密度芯片邊合成邊測(cè)序，代表有454，Solexa，SOLID，高通量，可一次獲得數(shù)G數(shù)據(jù)，相對(duì)與第三代，都仍然需要擴(kuò)增的方法放大信號(hào)，擴(kuò)增后再檢測(cè)。

三代測(cè)序：特點(diǎn)是單分子測(cè)序，多基于納米科技，無(wú)需擴(kuò)增，對(duì)單分鏈DNA/RNA直接用合成、降解、通過(guò)納米孔等方源式直接測(cè)序，核心特點(diǎn)是無(wú)需擴(kuò)增所以成本更低。

二手基因測(cè)序儀 二代技術(shù)中有哪些品牌突出？有哪些性能優(yōu)勢(shì)？

Roche公司的454測(cè)序平臺(tái)、Illumina公司的Solexa測(cè)序系統(tǒng)以及ABI公司的SOLID測(cè)序系統(tǒng)標(biāo)志著二代測(cè)序技術(shù)誕生。盡管各系統(tǒng)在高通量水平、測(cè)序準(zhǔn)確度、存儲(chǔ)格式、技術(shù)方法上各有差異，但共同特征是大大降低了測(cè)序成本并大大地提高了測(cè)序速度，完成一個(gè)人的基因組測(cè)序只需一周左右時(shí)間。然而二代測(cè)序技術(shù)在測(cè)序前要通過(guò)PCR段對(duì)待測(cè)片段進(jìn)行擴(kuò)增，增加了測(cè)序的錯(cuò)誤率。而且二代測(cè)序產(chǎn)生的測(cè)序結(jié)果長(zhǎng)度較短，需要對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行人工拼接，因此比較適合于對(duì)已知序列的基因組進(jìn)行重新測(cè)序，而在對(duì)全新的基因組進(jìn)行測(cè)序時(shí)還需要結(jié)合一代測(cè)序技術(shù)。

簡(jiǎn)而言之： Roche 454是焦磷酸測(cè)序； illumina Solexa是合成法測(cè)序； ABI SOLID是連接法測(cè)序。

就讀長(zhǎng)來(lái)看： Roche 454 > illumina Solexa > ABI SOLID。

就Reads數(shù)來(lái)看： ABI SOLID > illumina Solexa > Roche 454。

就應(yīng)用來(lái)看： Roche 454讀長(zhǎng)較長(zhǎng)，便于拼接 ，因此在denovo測(cè)序方面有很大優(yōu)勢(shì)；ABI SOLID雖然讀長(zhǎng)很短，但是Reads數(shù)多，而且ABI的色球編碼技術(shù)，使得每個(gè)堿基都會(huì)被讀取兩遍，準(zhǔn)確率很腐， 因此ABI SOL心在檢測(cè)SNP、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、ChIP-Seq等方面很有優(yōu)勢(shì)；illumina Solexa的讀長(zhǎng)和Reads數(shù)均位于中間，比較適合于基因組重測(cè)序。而在實(shí)際應(yīng)用中 ，由千Roche 454成本太商，因此illumina Solexa 也被較多的應(yīng)用于denovo測(cè)序。